如何将基因组序列定位到染色体上

如何将基因组序列定位到染色体上

基因的染色体定位方法多种多样,它可分为基因的遗传作图和物理作图,而物理作图中较好主要是荧光原位杂交(FISH)和放射杂交体(RH)二种。小弟提供目前主要的几种基因作图方法:荧光原位杂交(FISH),放射杂交体法(RH),脉冲场凝胶电泳(PFGE),Contig拼接(contig assembly)和染色体步移(chromosome walking),基因定位克隆(positional cloning),比较基因作图(comparative gene mapping)或比较物理图谱(comparative physical maps)

关于基因的染色体定位尚有不少其它的方法,其中OpGen公司的Whole Genome Mapping技术克服NGS短读支架(short read scaffold)的局限,生成长超级支架,完成装配达到接近染色体定位基因序列水平。目前国内好像有三台已经安装的机器,北京药值所有1台,天津生物芯片有1台,华大基因有1台。其中北京药值所的自己用,另外两家都承担对外服务项目。

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